ניתוח התנהגות בבתי הספר עוסק בדרכים לשיפור הלמידה של התלמידים, בבניית סביבה תומכת, העלאת המוטיבציה ושיפור האקלים הבית ספרי, וזאת על מנת לשפר ולקדם התנהגויות בעלות חשיבות חברתית.
מנתחי התנהגות עובדים במערכת החינוך במסגרות שונות ברחבי הארץ עם מגוון אוכלוסיות כגון, תלמידים עם בעיות התנהגות, הפרעות פסיכיאטריות, קשיי קשב וריכוז, לקויות למידה, אוטיזם ועוד. מנתחי התנהגות נמצאים בבתי ספר לחינוך מיוחד, יש העובדים בחינוך הרגיל בהנחיית צוותים ותמיכה של תכניות התנהגות לשיפור אקלים ומניעת קשיי התנהגות.
המנתחים המועסקים באמצעות מרכזי התמיכה הישוביים/אזוריים (מתי"א) עובדים בבתי הספר הרגילים בכיתות החינוך המיוחד ובשילוב ילדים עם צרכים מיוחדים הלומדים בכיתה רגילה.
בכל מתי"א מודל העבודה מעט שונה, אך הרעיון דומה: עבודה עם תלמידים בקבוצות קטנות, צפייה ונוכחות בשיעורים בכיתות, מודלינג והנחיית צוותים חינוכיים. מנתח ההתנהגות עובד בשיתוף עם הצוות הרב מקצועי ולוקח חלק בכתיבת תכניות התערבות ויישומן.
